More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0003 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.46 
 
 
758 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.79 
 
 
739 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  71.77 
 
 
802 aa  1169    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.41 
 
 
724 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.51 
 
 
804 aa  928    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.9 
 
 
743 aa  661    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.66 
 
 
739 aa  758    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.79 
 
 
739 aa  757    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.79 
 
 
739 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.54 
 
 
733 aa  747    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.03 
 
 
759 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74 
 
 
767 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.11 
 
 
803 aa  902    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.1 
 
 
758 aa  701    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.52 
 
 
754 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  75.22 
 
 
777 aa  1190    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.98 
 
 
803 aa  899    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.28 
 
 
759 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.83 
 
 
761 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.38 
 
 
766 aa  973    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.22 
 
 
761 aa  700    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.56 
 
 
768 aa  926    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.49 
 
 
767 aa  697    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.66 
 
 
739 aa  758    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.29 
 
 
737 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.73 
 
 
779 aa  854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
777 aa  1579    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.36 
 
 
740 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.71 
 
 
733 aa  729    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.3 
 
 
759 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.95 
 
 
744 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.72 
 
 
736 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.92 
 
 
739 aa  752    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.95 
 
 
779 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.66 
 
 
739 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.99 
 
 
779 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.68 
 
 
761 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.74 
 
 
768 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.08 
 
 
746 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.25 
 
 
739 aa  754    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.1 
 
 
760 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  51.26 
 
 
727 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.94 
 
 
741 aa  775    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  71.5 
 
 
775 aa  1144    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  72.87 
 
 
764 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.29 
 
 
739 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.79 
 
 
739 aa  755    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.36 
 
 
761 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.39 
 
 
739 aa  754    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.08 
 
 
733 aa  740    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.19 
 
 
742 aa  776    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.72 
 
 
760 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.72 
 
 
742 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.68 
 
 
730 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.87 
 
 
770 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  73.48 
 
 
767 aa  1156    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.43 
 
 
734 aa  660    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.79 
 
 
739 aa  758    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74.65 
 
 
782 aa  1154    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.17 
 
 
794 aa  968    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.12 
 
 
779 aa  850    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 
744 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.05 
 
 
750 aa  632  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.69 
 
 
737 aa  625  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.66 
 
 
733 aa  625  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.02 
 
 
752 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.28 
 
 
739 aa  621  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.46 
 
 
740 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.62 
 
 
740 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.03 
 
 
743 aa  622  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.4 
 
 
738 aa  622  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.46 
 
 
740 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.53 
 
 
749 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.19 
 
 
745 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.88 
 
 
742 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.26 
 
 
747 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.73 
 
 
735 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.64 
 
 
744 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.58 
 
 
741 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.72 
 
 
719 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.49 
 
 
729 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.9 
 
 
765 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 
737 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.49 
 
 
729 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.13 
 
 
758 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.83 
 
 
729 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.62 
 
 
751 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.91 
 
 
741 aa  603  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.48 
 
 
743 aa  602  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.28 
 
 
737 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.71 
 
 
737 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.31 
 
 
723 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.1 
 
 
728 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.02 
 
 
787 aa  602  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.24 
 
 
736 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.7 
 
 
727 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.12 
 
 
735 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.26 
 
 
736 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.46 
 
 
737 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.39 
 
 
741 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>