More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_R0012 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0077  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0075  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.928415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.903466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  93.7  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  98 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  98 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  98 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  98 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  98 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3280  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3281  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3282  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3283  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3284  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3285  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  94.92 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  98 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>