More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2300 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  84.15 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  81.72 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  73.59 
 
 		 284 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  70.07 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  69.72 
 
 		 284 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  63.44 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  61.29 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  61.65 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  60.93 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 284 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 284 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  58.45 
 
 		 284 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  285  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  48.72 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  45.82 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  47.92 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  48.26 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  44.17 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.95 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  46.35 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  45.79 
 
 		 285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  44.72 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  45.42 
 
 		 287 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  44.65 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  45.64 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  41.84 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  44.13 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  47.64 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  45.96 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  43.9 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  40.64 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  43.9 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  48.19 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  43.53 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  43.55 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  47.83 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  48.18 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  43.32 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  43.97 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 		 282 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  43.16 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  41.84 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  42.46 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  40.99 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>