86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2209 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  100 
 
 		 262 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  70.99 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  88.93 
 
 		 262 aa  358  5e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  61.07 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  61.07 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  48.47 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  47.33 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  53.44 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  53.44 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  47.71 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  52.29 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  50.38 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  48.09 
 
 		 277 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  52.69 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  53.82 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  52.67 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  49.62 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  50.76 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  50 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  38.78 
 
 		 262 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  33.97 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  38.4 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  39.16 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  38.4 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  33.08 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  32.69 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  33.2 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  35.09 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  24.12 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  28.46 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.86 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.93 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  24.35 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.45 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  27.24 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  27.1 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  25.76 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  24.53 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  25.32 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  27.31 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  25.75 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  24.42 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  21.86 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  21.86 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  21.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  21.86 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  21.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  21.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  21.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  21.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  21.86 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  21.4 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  29.84 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  29.84 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  19.48 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  22.69 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  27.76 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  21.32 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  23.5 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.32 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  25.57 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  22.8 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  28.7 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  25.66 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  23.39 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  23.08 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  22.22 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  22.99 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  28.72 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  24.72 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  19.53 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  32.65 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  33.8 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.5 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  29.53 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  27.51 
 
 		 295 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  29.37 
 
 		 267 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>