More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2205 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  57.19 
 
 		 674 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  57.19 
 
 		 674 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  53.64 
 
 		 690 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  53.13 
 
 		 690 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.71 
 
 		 738 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.13 
 
 		 670 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.47 
 
 		 676 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 680 aa  1384    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  77.61 
 
 		 680 aa  1063    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.89 
 
 		 679 aa  815    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.63 
 
 		 696 aa  895    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.48 
 
 		 697 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  54.73 
 
 		 678 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  53.14 
 
 		 684 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.93 
 
 		 774 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 672 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  47.54 
 
 		 670 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.2 
 
 		 670 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.18 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.51 
 
 		 669 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.36 
 
 		 669 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  48.27 
 
 		 661 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.06 
 
 		 669 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.06 
 
 		 669 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.05 
 
 		 663 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.36 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.06 
 
 		 669 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.3 
 
 		 677 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 667 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  45.78 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 667 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.37 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.73 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.97 
 
 		 673 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  43.79 
 
 		 659 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.95 
 
 		 670 aa  572  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  46.37 
 
 		 666 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.14 
 
 		 690 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.79 
 
 		 673 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.04 
 
 		 711 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 681 aa  566  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 685 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  44.99 
 
 		 690 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  45.37 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 		 691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  45.21 
 
 		 691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.77 
 
 		 691 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  44.69 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  46.27 
 
 		 684 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 683 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  43.15 
 
 		 673 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 670 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 685 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.25 
 
 		 688 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 682 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.57 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.56 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.87 
 
 		 690 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 673 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 		 746 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.92 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.22 
 
 		 648 aa  561  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  45.06 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  43.28 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  45.32 
 
 		 683 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  44.97 
 
 		 712 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.04 
 
 		 705 aa  557  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 670 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.71 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  44.15 
 
 		 678 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 665 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  42.75 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  43.7 
 
 		 662 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 681 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.23 
 
 		 708 aa  553  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.91 
 
 		 652 aa  549  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.62 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>