More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2120 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  100 
 
 
475 aa  943    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  75.55 
 
 
468 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  67.1 
 
 
505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  57.46 
 
 
465 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  48.71 
 
 
466 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  48.28 
 
 
466 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0179  isochorismate synthase  31.05 
 
 
470 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01971  isochorismate synthase  30.6 
 
 
470 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01951  isochorismate synthase  30.82 
 
 
470 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02061  isochorismate synthase  31.48 
 
 
465 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.48 
 
 
498 aa  213  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.87 
 
 
471 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.63 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.58 
 
 
445 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.14 
 
 
485 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  35.12 
 
 
467 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.4 
 
 
506 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  34.46 
 
 
451 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  34.84 
 
 
451 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  33.66 
 
 
452 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.08 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.08 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  34.67 
 
 
486 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.49 
 
 
554 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  31.65 
 
 
473 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  38.25 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.48 
 
 
464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  33.19 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  29.52 
 
 
464 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.65 
 
 
464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.65 
 
 
464 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.28 
 
 
464 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.5 
 
 
464 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.59 
 
 
464 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29 
 
 
464 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  36.69 
 
 
482 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.28 
 
 
464 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.07 
 
 
464 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.07 
 
 
464 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  39.77 
 
 
469 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.79 
 
 
476 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.11 
 
 
476 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.63 
 
 
460 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.81 
 
 
481 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  32.07 
 
 
471 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  30.75 
 
 
495 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  36.36 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  30.02 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  34.6 
 
 
482 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  32.34 
 
 
483 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.29 
 
 
473 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  29.97 
 
 
475 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.85 
 
 
477 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  34.63 
 
 
467 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.61 
 
 
484 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.61 
 
 
484 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.89 
 
 
481 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.7 
 
 
492 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  35.27 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  34.83 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  29.84 
 
 
418 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.86 
 
 
473 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.86 
 
 
476 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.86 
 
 
476 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  33.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.4 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  34.44 
 
 
477 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.07 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  26.29 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  36.23 
 
 
391 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.18 
 
 
453 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  36.8 
 
 
425 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.18 
 
 
453 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  36.23 
 
 
391 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  36.68 
 
 
391 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  36.68 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  36.68 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  36.68 
 
 
391 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.91 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  35.85 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  35.85 
 
 
391 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  28.61 
 
 
490 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  35.85 
 
 
391 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  35.85 
 
 
391 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  35.85 
 
 
391 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  35.85 
 
 
391 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  37.34 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  35.91 
 
 
391 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.95 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  32.22 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  31.72 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.02 
 
 
435 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  34.47 
 
 
435 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  31.7 
 
 
384 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  36.65 
 
 
425 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  36.51 
 
 
259 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.21 
 
 
435 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  36.16 
 
 
377 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  35.27 
 
 
442 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.15 
 
 
452 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>