82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2071 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 		 241 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  84.45 
 
 		 251 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  72.69 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  64.29 
 
 		 240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000386154  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  57.89 
 
 		 458 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.16 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2080  thymidylate synthase complementing protein ThyX  58.46 
 
 		 73 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.379936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.09 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.44 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  28.82 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  30.41 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  27.78 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.11 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  30.37 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  26.21 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  26.87 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.97 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.97 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  25.97 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.79 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  26.79 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  26.18 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  25.65 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.48 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.07 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  27.23 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  29.05 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  25.34 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  25.11 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  23.98 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  24.88 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  31.31 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.45 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.9 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  29.56 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  30.19 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.47 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  25.34 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25.7 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.73 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  28.24 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  25.56 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  29.41 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  27.98 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.65 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  24.18 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  26.48 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  22.49 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.5 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  27.65 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  27.65 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  28.1 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.22 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  25.45 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  24.54 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  31.67 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  23.35 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  25.68 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  24.86 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  30.16 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  26.94 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.64 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  36.67 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  21.78 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  24.19 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  27.12 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  25.4 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.22 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  28.73 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.62 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  30.51 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  22.95 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  23.9 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  32.61 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  30.51 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  29.03 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>