More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2043 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  64.2 
 
 
651 aa  737  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.45 
 
 
616 aa  900  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.06 
 
 
628 aa  656  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.69 
 
 
631 aa  643  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 
628 aa  662  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.63 
 
 
616 aa  894  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.42 
 
 
612 aa  918  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.03 
 
 
632 aa  686  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  57.89 
 
 
630 aa  669  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  77.85 
 
 
613 aa  964  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  54.31 
 
 
637 aa  640  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  80.45 
 
 
617 aa  1033  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  100 
 
 
617 aa  1235  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  58.47 
 
 
673 aa  668  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  75.36 
 
 
613 aa  917  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
615 aa  657  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  87.02 
 
 
602 aa  1038  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.98 
 
 
637 aa  641  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  80.78 
 
 
617 aa  1036  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.62 
 
 
637 aa  641  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  87.7 
 
 
615 aa  1031  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  82.14 
 
 
615 aa  999  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.99 
 
 
637 aa  642  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  79.87 
 
 
619 aa  1019  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.98 
 
 
637 aa  644  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  80.61 
 
 
617 aa  1034  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  55.92 
 
 
628 aa  665  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.45 
 
 
616 aa  900  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.06 
 
 
628 aa  656  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  59.05 
 
 
628 aa  682  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.05 
 
 
613 aa  915  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  97.57 
 
 
616 aa  1154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  82.14 
 
 
615 aa  999  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.66 
 
 
602 aa  645  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  75.08 
 
 
613 aa  903  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.2 
 
 
628 aa  681  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.75 
 
 
639 aa  636  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  56.21 
 
 
633 aa  639  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  57.31 
 
 
639 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.78 
 
 
640 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 
657 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.85756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  56.37 
 
 
638 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  54.23 
 
 
640 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
620 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 
630 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.19838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 
640 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  55.86 
 
 
632 aa  624  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 
640 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
643 aa  616  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.01 
 
 
627 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
656 aa  617  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 
655 aa  611  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.06 
 
 
630 aa  612  1e-174  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  55.16 
 
 
645 aa  615  1e-174  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.69 
 
 
640 aa  612  1e-174  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.74 
 
 
638 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  52.07 
 
 
650 aa  606  1e-172  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.06538e-06  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
655 aa  607  1e-172  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.17945e-06  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
644 aa  602  1e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.84191e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  54.44 
 
 
642 aa  605  1e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.16 
 
 
657 aa  602  1e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.45375e-05  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
652 aa  602  1e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.16 
 
 
657 aa  602  1e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.80208e-07  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.87 
 
 
608 aa  603  1e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
647 aa  602  1e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.79508e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.91 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.91 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  52.08 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.37455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
650 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.77959e-06  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  52.07 
 
 
647 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 
657 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.16 
 
 
649 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.91 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51 
 
 
657 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.61981e-06  hitchhiker  8.32625e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
647 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.28036e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.91 
 
 
647 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.14537e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
657 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.53792e-06  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  51.74 
 
 
659 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.24409e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 
657 aa  601  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.56985e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
638 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.08 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.7152e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  52.07 
 
 
644 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.83259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.88 
 
 
639 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.92 
 
 
651 aa  598  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
657 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.87677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
652 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  5.70756e-07  unclonable  9.18847e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
657 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.31825e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  52.08 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  52.08 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.35271e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.49 
 
 
608 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.86964e-12  hitchhiker  9.19555e-11 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
651 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.53513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
611 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
650 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.08 
 
 
614 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  51.9 
 
 
647 aa  596  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.9949e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  51.75 
 
 
643 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.99281e-05  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
637 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.4 
 
 
639 aa  598  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>