More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2024 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  84.91 
 
 		 211 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  70.19 
 
 		 220 aa  307  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  63.81 
 
 		 220 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  63.81 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  62.86 
 
 		 218 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  63.81 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  62.98 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  61.9 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  62.38 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  58.25 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  54.25 
 
 		 213 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  52.13 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.61 
 
 		 216 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  53.81 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  53.81 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  50.93 
 
 		 216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  48.33 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  36.23 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.96 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  36.59 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.86 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.02 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.01 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.29 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.21 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  42.06 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  32.24 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  43.81 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  42.2 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  29.5 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  38.26 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  42.02 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.71 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.67 
 
 		 781 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.25 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  30.32 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  29.15 
 
 		 808 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.39 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.27 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.74 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 785 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.88 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.86 
 
 		 828 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  29.95 
 
 		 805 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.58 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.58 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  29.06 
 
 		 802 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  32.71 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 		 804 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  33.13 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  28.5 
 
 		 813 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.64 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 807 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  29.1 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  28.93 
 
 		 809 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.8 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.46 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 835 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  28.78 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 843 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  33.91 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  27.05 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  32.46 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  31.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  25.13 
 
 		 785 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.35 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  30.65 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.62 
 
 		 784 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  23.98 
 
 		 817 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  30.68 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  28.21 
 
 		 802 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  28.72 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  29.26 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  27.69 
 
 		 785 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 		 789 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  27.32 
 
 		 818 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 799 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  24.62 
 
 		 785 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 797 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 784 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>