More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2022 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  91.23 
 
 		 399 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  92.23 
 
 		 399 aa  759    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  92.48 
 
 		 399 aa  753    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  811    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  96.74 
 
 		 399 aa  791    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  92.23 
 
 		 399 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  92.23 
 
 		 399 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  92.73 
 
 		 399 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  93.73 
 
 		 399 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  91.98 
 
 		 399 aa  751    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.25 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  77.51 
 
 		 409 aa  623  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  77.51 
 
 		 409 aa  621  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  75.79 
 
 		 409 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  75.85 
 
 		 410 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 399 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.71 
 
 		 399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  75.79 
 
 		 409 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  72.64 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000023337  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.35 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.35 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.37 
 
 		 400 aa  594  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  69.95 
 
 		 401 aa  591  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.54 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3892  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00189739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  74.13 
 
 		 397 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  unclonable  0.0000000372179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.54 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0319  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000444857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  72.03 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.03 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.54 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>