128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1999 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  100 
 
 		 524 aa  1078    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  80.95 
 
 		 514 aa  881    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  51.87 
 
 		 510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  50.75 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  51.21 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  46.5 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  48.8 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  45.86 
 
 		 543 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  48.03 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  44.88 
 
 		 531 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  45.5 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  51.29 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  42.28 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  40.77 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  38.7 
 
 		 414 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  37.8 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.21 
 
 		 543 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.24 
 
 		 531 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  79.87 
 
 		 188 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.64 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  35.28 
 
 		 518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  34.02 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  34.02 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  35.49 
 
 		 542 aa  229  9e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  33.27 
 
 		 426 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  33.58 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.07 
 
 		 561 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35.58 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  32.17 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  32.47 
 
 		 432 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  33.88 
 
 		 639 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  35.62 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  49.59 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.72 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  33.7 
 
 		 571 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  31.47 
 
 		 624 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  46.81 
 
 		 531 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.71 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.71 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  47.62 
 
 		 658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  36.39 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.14 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  51.09 
 
 		 572 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  43.86 
 
 		 643 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  46.42 
 
 		 622 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  31.42 
 
 		 578 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  43.77 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  55.15 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  31.14 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  55.68 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  49.54 
 
 		 529 aa  180  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  31.65 
 
 		 604 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  28.49 
 
 		 600 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  29.73 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.09 
 
 		 591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  30.58 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  30.58 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  43.7 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  31.31 
 
 		 606 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.06 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  48.89 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  48.89 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  39.75 
 
 		 645 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  39.42 
 
 		 632 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  27.03 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.88 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  43.75 
 
 		 550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  35.39 
 
 		 568 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  35.46 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  38.26 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  27.63 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  26.15 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.14 
 
 		 409 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  42.34 
 
 		 261 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  42.16 
 
 		 262 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  42.16 
 
 		 262 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  28.19 
 
 		 371 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.81 
 
 		 384 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.24 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  35.5 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  26.49 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  26.25 
 
 		 333 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  23.68 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  26.18 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  25.94 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.74 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.36 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.77 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.23 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 673 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  35.58 
 
 		 946 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.34 
 
 		 932 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  32.65 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.76 
 
 		 1036 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  39.56 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  29.45 
 
 		 255 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  22.47 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>