185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1870 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  100 
 
 
418 aa  833    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  64.02 
 
 
412 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  61.39 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  49.26 
 
 
411 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  49.26 
 
 
411 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  52.21 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  47.37 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  47.62 
 
 
409 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  46.37 
 
 
409 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  39.23 
 
 
417 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  39.23 
 
 
417 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  42.48 
 
 
426 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  39.66 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  40.62 
 
 
424 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.29 
 
 
432 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  40.57 
 
 
423 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  38.1 
 
 
433 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  38.21 
 
 
431 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  43.9 
 
 
422 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  41.13 
 
 
432 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  41.71 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  41.12 
 
 
423 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  40.59 
 
 
424 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  38.83 
 
 
416 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  40.96 
 
 
424 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  39.06 
 
 
426 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  36.97 
 
 
427 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  37.7 
 
 
425 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  34.95 
 
 
435 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  31.19 
 
 
500 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  32.39 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  30.97 
 
 
496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  30.31 
 
 
485 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  32.16 
 
 
492 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  29.43 
 
 
474 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  31.24 
 
 
536 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.03 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  25.39 
 
 
510 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.93 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  26.1 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  25.94 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  26.05 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  25.25 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  25.06 
 
 
502 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.85 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  24.83 
 
 
496 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  24.46 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  23.86 
 
 
493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  24.7 
 
 
490 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  24.7 
 
 
490 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  24.46 
 
 
490 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  22.86 
 
 
503 aa  60.1  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  24.46 
 
 
490 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.24 
 
 
512 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  24.24 
 
 
498 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  23.46 
 
 
483 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  24.55 
 
 
484 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  24.4 
 
 
496 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  24.76 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  24.76 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  24.76 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.5 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  22.94 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  23.46 
 
 
530 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  23.11 
 
 
501 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.27 
 
 
556 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  23.45 
 
 
482 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.55 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.5 
 
 
509 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  23.86 
 
 
493 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.94 
 
 
512 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  25.11 
 
 
515 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  25.39 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  21.51 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  25.12 
 
 
496 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.18 
 
 
505 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  23.87 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  25.16 
 
 
524 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  21.51 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.22 
 
 
496 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  25 
 
 
493 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  24.05 
 
 
493 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  23.62 
 
 
538 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  24.19 
 
 
501 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  24.71 
 
 
478 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  24.11 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  24.11 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.06 
 
 
493 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  24.84 
 
 
498 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  24.32 
 
 
493 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  23.36 
 
 
532 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  24.88 
 
 
491 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.69 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  24.11 
 
 
493 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.28 
 
 
495 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  24.78 
 
 
487 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  24.11 
 
 
493 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  24.35 
 
 
493 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27 
 
 
499 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>