283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1861 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  83.27 
 
 
282 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  49.12 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  45.91 
 
 
283 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  45.26 
 
 
306 aa  244  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  45.3 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  43.62 
 
 
283 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  43.62 
 
 
283 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  40.93 
 
 
280 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  42.55 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.97 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.08 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.26 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.3 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.49 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.39 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.41 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
138 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.29 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.45 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.39 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  26.14 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.32 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  25.6 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  30.88 
 
 
137 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
128 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.68 
 
 
147 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  45.45 
 
 
145 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  20.14 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  21.28 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25.77 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  27.66 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  21.28 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  34.93 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.57 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.61 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.5 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.46 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.37 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  46.43 
 
 
141 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.77 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  23.29 
 
 
296 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
128 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  30.71 
 
 
137 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.06 
 
 
141 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  28.17 
 
 
148 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  24.67 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.51 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  27.48 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
147 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  24.6 
 
 
316 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  33.87 
 
 
144 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  27.7 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  31.43 
 
 
137 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  25.43 
 
 
277 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  22.58 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.16 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  28.1 
 
 
144 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.08 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  24.71 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.35 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.28 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  34.52 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.73 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  25.96 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  33.68 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  34.65 
 
 
154 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  27.33 
 
 
164 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.09 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
144 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  19.91 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  20.09 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  33.96 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.46 
 
 
154 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  22.37 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.74 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  25.49 
 
 
160 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  28.57 
 
 
144 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  24.8 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  52.08 
 
 
166 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  24.52 
 
 
390 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  28.9 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  27.2 
 
 
319 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.66 
 
 
140 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  27.61 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.17 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  43.64 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  26.53 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  27.46 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>