27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1812 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1812  salt-stress induced hydrophobic peptide  100 
 
 		 68 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2905  protein of unknown function UPF0057  43.75 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3215  protein of unknown function UPF0057  43.75 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0810  hypothetical protein  47.62 
 
 		 52 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3915  hypothetical protein  43.75 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.932934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1909  hypothetical protein  61.11 
 
 		 52 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0986312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2519  hypothetical protein  68.57 
 
 		 52 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0701281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1940  protein of unknown function UPF0057  68.57 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1824  hypothetical protein  48.33 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3802  hypothetical protein  46.15 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0507  hypothetical protein  43.75 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4676  hypothetical protein  43.75 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000747615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0887  hypothetical protein  42.19 
 
 		 55 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0952  hypothetical protein  39.06 
 
 		 53 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0694  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3187  hypothetical protein  44.44 
 
 		 52 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00459993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3465  hypothetical protein  39.68 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0403  hypothetical protein  44.44 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5163  hypothetical protein  44.44 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.344873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0373  hypothetical protein  44.44 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.485112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6707  protein of unknown function UPF0057  38.1 
 
 		 52 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570236  normal  0.473948 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5980  stress induced protein  38.1 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1757  protein of unknown function UPF0057  39.68 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1753  Pmp3 family protein  39.68 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1072  hypothetical protein  38.1 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0505681  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0450  hypothetical protein  38.24 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>