More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1719 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  976    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  78.99 
 
 
477 aa  779    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  73.05 
 
 
476 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 
492 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 
476 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 
492 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
481 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
881 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
481 aa  559  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
482 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
481 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 
481 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
483 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
479 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
476 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
493 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
483 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
476 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
485 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
482 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
484 aa  327  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
479 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
485 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
469 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
469 aa  323  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
485 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
483 aa  315  8e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
491 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
488 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
470 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
490 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
471 aa  306  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
467 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
485 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
466 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
466 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
498 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
465 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
491 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
467 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
490 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
469 aa  302  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
475 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
471 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
486 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
469 aa  300  5e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
485 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
475 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
480 aa  299  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
463 aa  299  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
472 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
464 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
491 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
490 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
501 aa  298  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
481 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
498 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
472 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
473 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
491 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
498 aa  296  5e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
470 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
484 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
468 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
464 aa  293  5e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
484 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
470 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  35.92 
 
 
546 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
471 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
463 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
470 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
493 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
473 aa  289  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
471 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
466 aa  289  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
471 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
471 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
471 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
467 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
474 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>