More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1621 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1621  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.534029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0741  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  92.57 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  88.85 
 
 
296 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05991  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  88.18 
 
 
295 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1872  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.16 
 
 
296 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0543  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.84 
 
 
295 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05971  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.16 
 
 
296 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.848004  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05451  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.5 
 
 
296 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.240538  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05691  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.84 
 
 
295 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06071  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  87.16 
 
 
295 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.817258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6414  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  78.04 
 
 
301 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3537  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  75.96 
 
 
299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5358  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.04 
 
 
297 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.31 
 
 
312 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3978  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.31 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.475922  normal  0.178633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  71.91 
 
 
297 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0288  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.9 
 
 
297 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1931  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  70.9 
 
 
297 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5280  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.04 
 
 
297 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1845  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.04 
 
 
297 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  74.04 
 
 
297 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124271  normal  0.0880049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3721  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.01 
 
 
301 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0606642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0620  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  73.38 
 
 
295 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000136812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0158  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  72.13 
 
 
319 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.39 
 
 
312 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469245  hitchhiker  0.00416412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1316  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.04 
 
 
312 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2039  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  77 
 
 
302 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1634  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  76.12 
 
 
301 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.948044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.38 
 
 
276 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1908  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.51 
 
 
273 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52 
 
 
275 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1538  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  52.77 
 
 
273 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.37 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.1 
 
 
275 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.74 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.64 
 
 
275 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  50.37 
 
 
275 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3478  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.29 
 
 
273 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2375  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.68 
 
 
304 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0819  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.3 
 
 
289 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.147693  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0791  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  55.3 
 
 
289 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2306  light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  54.58 
 
 
288 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2332  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.82 
 
 
307 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1532  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.05 
 
 
288 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.185742  normal  0.0569964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3939  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  53.82 
 
 
286 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1419  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  51.91 
 
 
286 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  40.67 
 
 
292 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  41.2 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  42.16 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  40.82 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.76 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  41.18 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  39.93 
 
 
290 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.15 
 
 
270 aa  175  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  42.06 
 
 
272 aa  175  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  39.15 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  37.09 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  41.26 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.2 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  41.6 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  41.67 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  40 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  39.18 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  38.76 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.9 
 
 
265 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  38.43 
 
 
324 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  39.6 
 
 
289 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  40.8 
 
 
324 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.67 
 
 
289 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  41.27 
 
 
289 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  41.2 
 
 
731 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  41.27 
 
 
293 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  40.64 
 
 
290 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  40.24 
 
 
295 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  40 
 
 
288 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  40.64 
 
 
288 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  35.97 
 
 
292 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  39.85 
 
 
292 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  39.68 
 
 
289 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  37.93 
 
 
292 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  40.48 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  39.84 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  38.38 
 
 
289 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  34.21 
 
 
264 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  40 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  40.56 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  38.38 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  37.55 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  39.93 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  36.19 
 
 
276 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  37.64 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  36.4 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  39.6 
 
 
298 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  40.32 
 
 
288 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  39.29 
 
 
289 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.25 
 
 
284 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  37.85 
 
 
288 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  38.8 
 
 
290 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  39.84 
 
 
299 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  38.65 
 
 
300 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>