77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1547 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 388 aa  761    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  85.38 
 
 		 385 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  75.21 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  66.57 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  62.53 
 
 		 369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  62.81 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  62.81 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  60.98 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  61.25 
 
 		 369 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  63.66 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  49.44 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  47.75 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  44.6 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  46.59 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  45.74 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  46.31 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  44.19 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  44.19 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  36.2 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  37.05 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  36.7 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  33.86 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  38.75 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  38.38 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  33.7 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  35.1 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  38.11 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  38.03 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  36.97 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  37 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  33.89 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  35.93 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  41.88 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  41.75 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  43.81 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  35.37 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  41.2 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  42.27 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  38.18 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  35.19 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  35.19 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  39.1 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  36.52 
 
 		 361 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  33.21 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  42.05 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  34.05 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  38.75 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  37.07 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  34.36 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  41.75 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  37.7 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  41.88 
 
 		 168 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  35.09 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 625 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  28.12 
 
 		 671 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 631 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  27.43 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  33.09 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  28.89 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  34.09 
 
 		 634 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  30.94 
 
 		 629 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  29.71 
 
 		 630 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>