More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1530 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.64 
 
 		 479 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.87 
 
 		 480 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.64 
 
 		 481 aa  832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  978    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.29 
 
 		 480 aa  919    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.64 
 
 		 479 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.43 
 
 		 479 aa  718    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 		 479 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.45 
 
 		 489 aa  866    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.66 
 
 		 480 aa  799    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.22 
 
 		 479 aa  753    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.37 
 
 		 477 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.64 
 
 		 476 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 		 476 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 		 475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.32 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 		 478 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.15 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 543 aa  505  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  53.98 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.75 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 		 470 aa  276  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 463 aa  275  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.69 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 		 593 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.33 
 
 		 467 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 		 473 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.88 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.9 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 462 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.71 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.85 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 585 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.45 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.77 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 466 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 		 602 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.24 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 478 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 478 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 476 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 		 476 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.61 
 
 		 466 aa  256  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.77 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.27 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.41 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.3 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.83 
 
 		 468 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.61 
 
 		 466 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.68 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.06 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 		 465 aa  253  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 		 466 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>