60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1458 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  55.14 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  39.13 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  39.13 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  36.51 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  41.08 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  38.59 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  38.95 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  35.11 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.86 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  39.15 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.26 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.26 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.94 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.79 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.98 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.69 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  29.53 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  26.64 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.14 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.06 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.86 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.16 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.02 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.74 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.14 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.91 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.02 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  30.1 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.91 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.97 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.91 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.91 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.53 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1193  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  26.72 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.120048 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.91 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.46 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.93 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.42 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.81 
 
 		 184 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.69 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24050  pyridoxamine-phosphate oxidase  31.68 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.37 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.37 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1259  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.92 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000619005  normal  0.0127677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.2 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  20.99 
 
 		 206 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.76 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.84 
 
 		 215 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.21 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.38 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.13 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  0.0000390202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.67 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.32 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.151005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>