289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1287 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  84.03 
 
 
144 aa  256  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  62.32 
 
 
150 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  53.15 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  53.23 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  41.13 
 
 
138 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10181  hypothetical protein  43.06 
 
 
137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  38.19 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  38.19 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  42.07 
 
 
147 aa  106  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  38.22 
 
 
159 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  39.24 
 
 
159 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 
156 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 
156 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  41.72 
 
 
154 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  41.45 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
156 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  40.79 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  37.66 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  37.91 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  38.31 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  35.53 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  36.77 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 
156 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 
159 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  37.33 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  39.19 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  34.84 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  37.34 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  36.88 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 
159 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
177 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  34.42 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  40.43 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  35.29 
 
 
155 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  37.33 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  46.24 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  37.33 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2527  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.28 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  35.95 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.62 
 
 
162 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  36.18 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  37.09 
 
 
155 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  37.25 
 
 
155 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  37.25 
 
 
155 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  34.21 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.41 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  34.21 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>