More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1279 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  66.6 
 
 
489 aa  655  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  82.63 
 
 
493 aa  813  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
495 aa  976  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  77.58 
 
 
495 aa  744  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  60.69 
 
 
496 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  60.69 
 
 
496 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  57.37 
 
 
486 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  54.77 
 
 
489 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  55.78 
 
 
489 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  54.9 
 
 
487 aa  539  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  51.45 
 
 
464 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  50.41 
 
 
471 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 
470 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 
470 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  49.59 
 
 
461 aa  448  1e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  50.21 
 
 
474 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  48.07 
 
 
470 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  50.75 
 
 
464 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  41.18 
 
 
515 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.14 
 
 
761 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  38.91 
 
 
474 aa  260  5e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.33 
 
 
911 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  38 
 
 
468 aa  252  8e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 
534 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  33.71 
 
 
885 aa  246  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  36.72 
 
 
533 aa  244  2e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 
532 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.14 
 
 
533 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 
532 aa  243  8e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.44 
 
 
532 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 
533 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.32 
 
 
533 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.99 
 
 
535 aa  240  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 
594 aa  239  7e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.32 
 
 
473 aa  239  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 
530 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.56 
 
 
605 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  35.97 
 
 
487 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  42.73 
 
 
461 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.84 
 
 
533 aa  236  5e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.22 
 
 
848 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.57 
 
 
532 aa  235  1e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  39.87 
 
 
457 aa  234  2e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  43.49 
 
 
416 aa  235  2e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.26 
 
 
849 aa  234  4e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.84 
 
 
525 aa  234  4e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  36.21 
 
 
532 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 
530 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  36.88 
 
 
533 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 
413 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  34.59 
 
 
594 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 
531 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 
531 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  34.59 
 
 
594 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.8 
 
 
533 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  46.69 
 
 
403 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 
534 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 
989 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  35.78 
 
 
512 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  37.56 
 
 
616 aa  227  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.24 
 
 
856 aa  226  5e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.88 
 
 
533 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.78 
 
 
532 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  43.9 
 
 
410 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.19 
 
 
853 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  47.86 
 
 
735 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.78 
 
 
533 aa  222  1e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  35.06 
 
 
462 aa  221  2e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.22922e-05  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 
535 aa  220  4e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.02 
 
 
839 aa  220  4e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  37.3 
 
 
524 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  45.39 
 
 
415 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 
620 aa  219  8e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 
595 aa  219  9e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  43.01 
 
 
411 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  43.01 
 
 
403 aa  218  3e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 
533 aa  217  3e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.76 
 
 
856 aa  218  3e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  34.82 
 
 
625 aa  217  3e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.86 
 
 
533 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  35.73 
 
 
554 aa  216  1e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  42.32 
 
 
406 aa  216  1e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.57 
 
 
503 aa  214  2e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 
619 aa  214  3e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  39.94 
 
 
419 aa  213  5e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  34.95 
 
 
609 aa  213  6e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  35.76 
 
 
623 aa  213  8e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  39.94 
 
 
419 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  33.86 
 
 
632 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  32.9 
 
 
613 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  33.61 
 
 
607 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  38.07 
 
 
621 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  32.9 
 
 
613 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
604 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
615 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>