67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1270 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1270  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07231  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  72.66 
 
 		 131 aa  206  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1200  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  81.06 
 
 		 145 aa  206  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16351  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  71.65 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.109557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0138  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  64.52 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07701  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  62.9 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0584131 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10061  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  53.23 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.292837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09361  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  49.61 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09371  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  50.39 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.596891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0877  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  48.82 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3633  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  38.46 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3653  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4123  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4084  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3304  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1438  putative anti-sigma regulatory factor  39.84 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0533473  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2243  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0809953  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  27.87 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0401  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.48 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0141  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  35.16 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  32.38 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.65 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  31.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1112  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1471  putative signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2761  response regulator receiver  27.86 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  26.42 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1623  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2394  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  25.98 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  27.97 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 321 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1516  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.124385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0773  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 472 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  28.09 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1385 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  34.43 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  31.52 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3703  response regulator receiver  30.58 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2999  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 448 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  28.09 
 
 		 390 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  25.4 
 
 		 146 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  27.66 
 
 		 139 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>