98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1251 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  88.95 
 
 
389 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  100 
 
 
389 aa  785    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  71.21 
 
 
389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  70.57 
 
 
390 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  66.49 
 
 
391 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  66.23 
 
 
391 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  65.71 
 
 
390 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  64.92 
 
 
390 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  64.08 
 
 
390 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  63.82 
 
 
390 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  53.89 
 
 
392 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  52.09 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  49.74 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  50.53 
 
 
385 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  51.05 
 
 
384 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  48.95 
 
 
388 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  48.69 
 
 
388 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  46.86 
 
 
383 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  46.6 
 
 
383 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  45.95 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  43.15 
 
 
390 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  44.39 
 
 
385 aa  348  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  44.24 
 
 
388 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  43.29 
 
 
395 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  41.9 
 
 
392 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  41.75 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  44.22 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  40 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  31.73 
 
 
402 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  33.77 
 
 
393 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  27.42 
 
 
402 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 
392 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.27 
 
 
376 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.39 
 
 
375 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 
407 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
406 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  27.14 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  25.57 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  27.88 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.76 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.69 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  24.94 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  22.73 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.77 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.69 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  22.11 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  22.34 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  21.87 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  27.57 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  24.02 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  22.53 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  22.54 
 
 
401 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  20.26 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  28.57 
 
 
397 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  22.7 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
856 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  25.95 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  25.95 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  25.95 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  25.95 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  23.91 
 
 
400 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  26.37 
 
 
401 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  21.81 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  20.1 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  23.97 
 
 
789 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
401 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  20.25 
 
 
349 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  22.91 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  23.08 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  26.52 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  25.52 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  21.6 
 
 
792 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  24.16 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  22.1 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  23.81 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.95 
 
 
377 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  22.61 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>