More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1140 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 		 509 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 516 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 516 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1064    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  79.77 
 
 		 514 aa  838    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 515 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 514 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 530 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 533 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 511 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 509 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 653 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 645 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 648 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 632 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 655 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 650 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 645 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 651 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39.61 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 634 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 650 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 645 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 638 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 653 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 671 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 522 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 522 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 536 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 660 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 660 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 522 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 517 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 660 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 666 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 657 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 656 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 530 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 659 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 681 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 657 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 545 aa  365  1e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>