More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1075 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  100 
 
 
324 aa  661    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1424  ATPase  73.6 
 
 
330 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0734659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  61.06 
 
 
322 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  46.5 
 
 
344 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 
355 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  44.89 
 
 
355 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  42.09 
 
 
356 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  56.02 
 
 
360 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  41.9 
 
 
363 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  40.99 
 
 
359 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  42.45 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.07 
 
 
361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.19 
 
 
360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.92 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  40.9 
 
 
358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  42.09 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  51.7 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.44 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.36 
 
 
353 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  40.58 
 
 
352 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  41.74 
 
 
355 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  43.29 
 
 
379 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 
349 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
352 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 
349 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  44.19 
 
 
346 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 
381 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  44.19 
 
 
346 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  50 
 
 
336 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  42.69 
 
 
355 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  42.05 
 
 
356 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  45.14 
 
 
357 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 
351 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  56.49 
 
 
359 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 
351 aa  269  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  41.33 
 
 
361 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  41.76 
 
 
354 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  39.39 
 
 
373 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  45.81 
 
 
341 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  40.56 
 
 
350 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  44.13 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  40.62 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  56.07 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  41.83 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.82 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  41.29 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
356 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  41.83 
 
 
355 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.14 
 
 
369 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
362 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  41.23 
 
 
354 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  42 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.88 
 
 
366 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  49.8 
 
 
367 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  43.16 
 
 
338 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
366 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.29 
 
 
369 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  39.73 
 
 
369 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  41.76 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.76 
 
 
352 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  41.06 
 
 
360 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  41.01 
 
 
353 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
369 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1694  hypothetical protein  39.89 
 
 
363 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  39.89 
 
 
363 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 
356 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 
358 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
369 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
360 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  40.55 
 
 
369 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  42.33 
 
 
355 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
369 aa  264  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
369 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  40.22 
 
 
365 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  45.39 
 
 
375 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
359 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.55 
 
 
369 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  44.41 
 
 
331 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  40.62 
 
 
354 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  40.97 
 
 
355 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 
356 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  49.79 
 
 
353 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  42.3 
 
 
386 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  41.23 
 
 
359 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  42.02 
 
 
360 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  44.48 
 
 
368 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  42.81 
 
 
369 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  41.74 
 
 
360 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>