29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1071 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  84.88 
 
 		 88 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  58.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  58.14 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  56.98 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  56.32 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  55.81 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  53.49 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  53.49 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  53.49 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  50 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  56.79 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  50 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  50 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  63.16 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  63.16 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  51.16 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  41.49 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  57.3 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  40 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.07 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  36.36 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  36.49 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.23 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  38.37 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.23 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  32.91 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.37 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.71 
 
 		 84 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>