50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1017 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  64.23 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  61.15 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
147 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
144 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  43.28 
 
 
158 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
525 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.43 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  32.48 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  34.55 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
291 aa  43.9  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
183 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
197 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.98 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  35 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  23.45 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
130 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  23.45 
 
 
205 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  35.59 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.32 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  31.08 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3150  phosphohydrolase  31.08 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.696001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  45 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  23.45 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  23.45 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
136 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>