41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0897 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  82.93 
 
 
123 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  83.74 
 
 
122 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  84.35 
 
 
118 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  83.48 
 
 
116 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  83.48 
 
 
118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  83.48 
 
 
118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  81.3 
 
 
123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  70.73 
 
 
129 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  75.86 
 
 
118 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  75.86 
 
 
118 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  71.31 
 
 
122 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  72.13 
 
 
122 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  74.58 
 
 
129 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  67.21 
 
 
128 aa  164  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  56.56 
 
 
125 aa  140  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  50.41 
 
 
124 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  49.59 
 
 
126 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  49.59 
 
 
126 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  51.26 
 
 
140 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  48.33 
 
 
137 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  48.65 
 
 
121 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  47.93 
 
 
133 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  49.12 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  47.11 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  43.8 
 
 
137 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  43.22 
 
 
144 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  42.37 
 
 
145 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  45.95 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  41.88 
 
 
144 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  39.32 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  41.67 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  42.15 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  41.67 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  41.32 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  39.17 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  41.32 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  39.17 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  41.07 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  39.82 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>