More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0850 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  100 
 
 
246 aa  493  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  91.84 
 
 
247 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  77.64 
 
 
246 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.38 
 
 
248 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  71.97 
 
 
248 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  71.78 
 
 
248 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  66.12 
 
 
246 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.53 
 
 
246 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  60.82 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.27 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  62.04 
 
 
258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.82 
 
 
247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  60.33 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.81 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.63 
 
 
246 aa  304  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.44 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  60.33 
 
 
253 aa  292  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 
245 aa  289  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.39 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.97 
 
 
263 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  59.75 
 
 
262 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.3 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  59.18 
 
 
243 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  57.44 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 
269 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.95 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.52 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.55 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.2 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 
253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.14 
 
 
254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.77 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.61 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.56 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.56 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.13 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  59.18 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  58.26 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  61.18 
 
 
241 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.37 
 
 
240 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.77 
 
 
243 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.05 
 
 
255 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  57.14 
 
 
251 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.66 
 
 
242 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  57.79 
 
 
256 aa  279  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.5 
 
 
250 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.73 
 
 
255 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.63 
 
 
242 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  59.32 
 
 
251 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  55.74 
 
 
262 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.97 
 
 
269 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  55.74 
 
 
262 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  58.68 
 
 
250 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.79 
 
 
242 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  54.73 
 
 
254 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.85 
 
 
248 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  58.01 
 
 
252 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.08 
 
 
242 aa  278  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  56.73 
 
 
244 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.45 
 
 
259 aa  277  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  56.79 
 
 
257 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  59.92 
 
 
253 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.32 
 
 
247 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  55.92 
 
 
244 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  56.38 
 
 
247 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55.37 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  56.63 
 
 
251 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  56.2 
 
 
247 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 
244 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.5 
 
 
245 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  58.05 
 
 
254 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  56.61 
 
 
248 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  58.05 
 
 
251 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.61 
 
 
244 aa  275  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.33 
 
 
263 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  56.79 
 
 
248 aa  275  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  57.02 
 
 
252 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  54.92 
 
 
262 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.08 
 
 
248 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  56.56 
 
 
258 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  58.37 
 
 
255 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.13 
 
 
249 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.56 
 
 
255 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  60 
 
 
251 aa  275  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  56.61 
 
 
242 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  54.92 
 
 
257 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  55.74 
 
 
267 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.38 
 
 
256 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.05 
 
 
254 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  58.92 
 
 
258 aa  274  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  54.92 
 
 
267 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  58.92 
 
 
258 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  53.72 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>