42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0824 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  83.13 
 
 
83 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  60 
 
 
72 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  48.44 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  43.06 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15711  high light inducible protein  51.79 
 
 
68 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  43.06 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12921  high light inducible protein  50 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.872444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15981  high light inducible protein  51.79 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04211  high light inducible protein  46.55 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15821  high light inducible protein-like protein  50 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1510  high light inducible protein-like  46.55 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.513618  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13681  high light inducible protein  51.11 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08911  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17481  high light inducible protein  45.45 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.598336  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1481  high light inducible protein-like  48.21 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13181  hypothetical protein  42.37 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.655932  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1228  high light inducible protein-like  43.1 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13041  high light inducible protein  43.1 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11651  hypothetical protein  46.43 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  61.54 
 
 
63 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08761  high light inducible protein  42.42 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  50.98 
 
 
50 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  49.02 
 
 
50 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  64.1 
 
 
50 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0886  high light inducible protein  44.68 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17411  high light inducible protein  38.98 
 
 
97 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0053  high light-inducible protein-like  82.61 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.987814  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  48.98 
 
 
50 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  56.41 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  56.41 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14781  high light inducible protein  40.43 
 
 
92 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  38.3 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0050  high light-inducible protein-like  81.82 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  38.3 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11391  hypothetical protein  42 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.846337  hitchhiker  0.00367136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00521  high light inducible protein-like protein  50.98 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  38.3 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  46.94 
 
 
50 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0433  hypothetical protein  42 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0358562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>