More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0761 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1025    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  77.95 
 
 		 511 aa  771    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  55.25 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  55.45 
 
 		 509 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  50.3 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  49.9 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  49.5 
 
 		 509 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  51.79 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  58.12 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  47.68 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  48.9 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 		 512 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  41.19 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  39.03 
 
 		 595 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  40.48 
 
 		 513 aa  349  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  37.18 
 
 		 598 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 506 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  38.42 
 
 		 645 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.85 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  35.62 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  34.34 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  34.44 
 
 		 635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  33.07 
 
 		 512 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  32.87 
 
 		 512 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  32.74 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  33.33 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  33.46 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  34.13 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.1 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.71 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  33.73 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  31.97 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  32 
 
 		 504 aa  213  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  30.41 
 
 		 514 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  30.43 
 
 		 514 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  30.93 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 532 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  30.47 
 
 		 508 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  28.71 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  30.48 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  32.75 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  28.68 
 
 		 522 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  29.39 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.16 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.33 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.1 
 
 		 938 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 717 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.84 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.41 
 
 		 504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.49 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.35 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  24.15 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.95 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.07 
 
 		 511 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.76 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  26.15 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.99 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  25.29 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  29.29 
 
 		 711 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.8 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 554 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  25.73 
 
 		 508 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.38 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.71 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.21 
 
 		 708 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.84 
 
 		 507 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.12 
 
 		 507 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.65 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  23.06 
 
 		 508 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 547 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  23.87 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.68 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.44 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.39 
 
 		 501 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.63 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  24.76 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.04 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.22 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.98 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  23.13 
 
 		 546 aa  90.5  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 520 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  26.05 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.15 
 
 		 518 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 516 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  26.78 
 
 		 498 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  22.77 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  23.38 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>