76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0667 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  78.14 
 
 		 460 aa  725    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  82.02 
 
 		 460 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  74.46 
 
 		 460 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  82.56 
 
 		 459 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  78.14 
 
 		 460 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  78.88 
 
 		 464 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  75.97 
 
 		 460 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  77.92 
 
 		 460 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  79.03 
 
 		 473 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  82.44 
 
 		 459 aa  776    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  82.34 
 
 		 461 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  77.92 
 
 		 460 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  98.05 
 
 		 462 aa  914    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  75.97 
 
 		 460 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  77.48 
 
 		 461 aa  720    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  100 
 
 		 462 aa  935    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  82.02 
 
 		 460 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  78.89 
 
 		 459 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  57.4 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  52.63 
 
 		 522 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  51.09 
 
 		 359 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  53.14 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  49.64 
 
 		 342 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  48.91 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  49.11 
 
 		 342 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  41.01 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  39.21 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  38.43 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  36.76 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  38.65 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  37.94 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  37.94 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  37.46 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  37.32 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  35.95 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  35.95 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  37.28 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  36.92 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  35.74 
 
 		 362 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  35.74 
 
 		 362 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  34.45 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  33.21 
 
 		 351 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  35.61 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  35.61 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  39.21 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  35.39 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  32.37 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  31.47 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  32.37 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  32.14 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  32.14 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  32.37 
 
 		 354 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  32.37 
 
 		 354 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  33.09 
 
 		 352 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  30.07 
 
 		 370 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  30.07 
 
 		 370 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  31.07 
 
 		 349 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.95 
 
 		 507 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.95 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.76 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.47 
 
 		 507 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.9 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.14 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  25.05 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  25.05 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.8 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  23.4 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  24.12 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  24.75 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  24.66 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  23.75 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.47 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  22.67 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  22.67 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.33 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>