More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0647 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  67.34 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  66.83 
 
 		 220 aa  264  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  59.9 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  56.77 
 
 		 213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  56.77 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  53.12 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  53.12 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  52.6 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  51.85 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  50.25 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 224 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  43 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  42.65 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  45.55 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.1 
 
 		 229 aa  147  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42.64 
 
 		 235 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  41.5 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.87 
 
 		 236 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  42.05 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  42.05 
 
 		 228 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.29 
 
 		 229 aa  143  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  42.42 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  41.09 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  41.18 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  43.22 
 
 		 232 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  41.54 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  40.91 
 
 		 228 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  38.73 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.7 
 
 		 231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  42.29 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  46.19 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  42.51 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  42.71 
 
 		 235 aa  137  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.5 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  40.99 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  40.7 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.69 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  41.55 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.59 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  43 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  34.31 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  39.18 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 249 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.69 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  44.22 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  38.31 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  34 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.92 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  39 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  41.21 
 
 		 257 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  40.7 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  37.37 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  38 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  40.7 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.43 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  40.7 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  35.03 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  37.75 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.37 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  37.06 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  37.06 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 241 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  37.81 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.61 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.29 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  40.2 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  36.08 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.82 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.39 
 
 		 235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  38.12 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  41.62 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 248 aa  127  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 220 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  38.24 
 
 		 241 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  41.03 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.69 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  38.81 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  32.14 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  37.63 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.31 
 
 		 244 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  36.95 
 
 		 271 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  40.8 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  41.71 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>