296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0638 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  100 
 
 
972 aa  1995    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  55.12 
 
 
1003 aa  979    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.43 
 
 
1030 aa  253  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.95 
 
 
610 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  38.06 
 
 
731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
958 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1486 aa  175  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
632 aa  172  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
808 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
988 aa  170  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.12 
 
 
1182 aa  167  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
832 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
1275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
996 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
1509 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
1334 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
796 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  29.4 
 
 
733 aa  162  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
709 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
709 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
576 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
1152 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
1152 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
723 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
602 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.43 
 
 
809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 
1561 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
625 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
625 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
625 aa  148  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
1067 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
983 aa  148  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
880 aa  146  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
794 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 
958 aa  144  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
586 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
1359 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
617 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
710 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
1759 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
765 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
783 aa  138  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
729 aa  138  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
717 aa  138  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
658 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
790 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
775 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
717 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
662 aa  135  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.09 
 
 
1644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.09 
 
 
1644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.2 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
728 aa  128  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 
721 aa  127  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
531 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.69 
 
 
632 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
526 aa  125  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
635 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
784 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
684 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  26.34 
 
 
810 aa  123  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
670 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
653 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
1297 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.71 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
555 aa  118  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
742 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  31.16 
 
 
321 aa  116  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
1991 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
684 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
551 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
742 aa  111  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
539 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
551 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
1188 aa  107  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.85 
 
 
2401 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
857 aa  105  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
725 aa  104  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
525 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  25.92 
 
 
732 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
1084 aa  100  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
1198 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.09 
 
 
305 aa  99.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
1044 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
725 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.87 
 
 
968 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
556 aa  94  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
679 aa  92  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.69 
 
 
1366 aa  92  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
510 aa  92  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1177 aa  92  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
853 aa  92  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
1386 aa  91.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
1739 aa  91.3  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
415 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
994 aa  89.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>