More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0633 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 1161 aa  2424    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  64.35 
 
 		 1162 aa  1590    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 1061 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 398 aa  195  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.16 
 
 		 916 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 		 579 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 438 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.87 
 
 		 1366 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 406 aa  148  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  26.76 
 
 		 751 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.76 
 
 		 751 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 327 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  30.58 
 
 		 413 aa  129  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 1297 aa  129  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  28.06 
 
 		 404 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 406 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 828 aa  109  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 846 aa  104  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 1600 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  25.35 
 
 		 513 aa  102  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 305 aa  101  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  30.43 
 
 		 314 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  30.43 
 
 		 314 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  30.43 
 
 		 314 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  30.04 
 
 		 695 aa  97.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  30.43 
 
 		 314 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 320 aa  93.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  27.71 
 
 		 686 aa  89.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 292 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.75 
 
 		 519 aa  89.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 1236 aa  89  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 305 aa  89.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 313 aa  88.6  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  30.83 
 
 		 631 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 314 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 322 aa  87  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 308 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  30.43 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 327 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 327 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3545  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 		 666 aa  80.9  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  28.63 
 
 		 303 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 306 aa  77  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 364 aa  77  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 507 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  28.26 
 
 		 308 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 308 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.17 
 
 		 304 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 1152 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 1152 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  36.19 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 1082 aa  68.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.78 
 
 		 2796 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  36.73 
 
 		 325 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 311 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  45.76 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  38.67 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 1301 aa  65.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  44 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  43.42 
 
 		 1067 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.26 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.26 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 235 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 324 aa  64.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 746 aa  63.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 304 aa  63.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 316 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  38.71 
 
 		 260 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  37.33 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 		 857 aa  62.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.68 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  24.07 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  41.33 
 
 		 115 aa  62  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  62  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 1264 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 665 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 663 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 335 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  36.96 
 
 		 341 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 814 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 321 aa  61.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 337 aa  60.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  34.52 
 
 		 2342 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  34.52 
 
 		 2342 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>