13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0578 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0578  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2093  hypothetical protein  79.81 
 
 
219 aa  345  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05701  hypothetical protein  64.65 
 
 
218 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13751  hypothetical protein  54.04 
 
 
200 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
227 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  37.06 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  36.55 
 
 
240 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  37.88 
 
 
226 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  37.88 
 
 
226 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  34.52 
 
 
207 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  38.05 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
257 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>