More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0529 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  94.95 
 
 
99 aa  196  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  91.92 
 
 
99 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  90.91 
 
 
99 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  90.91 
 
 
99 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  91.92 
 
 
99 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  90.91 
 
 
99 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  84.85 
 
 
99 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  81.82 
 
 
99 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  83.84 
 
 
99 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  80.81 
 
 
99 aa  171  3e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  80.81 
 
 
99 aa  171  3e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  79.8 
 
 
99 aa  171  4e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  77.78 
 
 
99 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  76.04 
 
 
100 aa  164  3e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
98 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  73.74 
 
 
123 aa  151  3e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  62.63 
 
 
99 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  70.41 
 
 
103 aa  139  1e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  61.62 
 
 
99 aa  139  2e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  66.33 
 
 
96 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  60.4 
 
 
104 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  62.24 
 
 
94 aa  127  4e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  59.79 
 
 
104 aa  126  1e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  59.79 
 
 
104 aa  126  1e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  63.64 
 
 
98 aa  125  1e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  56.86 
 
 
104 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  54.08 
 
 
99 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
102 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52883e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
99 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  57.58 
 
 
97 aa  117  4e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  53.54 
 
 
106 aa  115  1e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
94 aa  115  1e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  65.06 
 
 
88 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  47.47 
 
 
106 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 
106 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
268 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 
106 aa  107  4e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  50.51 
 
 
111 aa  107  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  57.89 
 
 
99 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  59.76 
 
 
112 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
99 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  49.43 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  44.79 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  44.79 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  51.19 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  39.39 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.66855e-11  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.37 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  48.39 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  41 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  46.24 
 
 
193 aa  82.8  1e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
113 aa  82  2e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  45.78 
 
 
350 aa  82  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  42.27 
 
 
105 aa  82  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  47.73 
 
 
111 aa  82  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  43.01 
 
 
200 aa  81.3  4e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  46.15 
 
 
94 aa  80.1  1e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  53.85 
 
 
351 aa  77.8  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 
108 aa  77.8  5e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  43.56 
 
 
108 aa  76.6  9e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  38.54 
 
 
121 aa  76.6  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.45 
 
 
351 aa  76.3  1e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  44.44 
 
 
93 aa  75.5  2e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  45.21 
 
 
89 aa  75.5  2e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  40.86 
 
 
193 aa  75.9  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  45.21 
 
 
101 aa  75.1  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  37.11 
 
 
122 aa  74.7  3e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  50.63 
 
 
108 aa  74.7  3e-13  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
109 aa  75.1  3e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  38.55 
 
 
356 aa  74.3  5e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  41.38 
 
 
366 aa  73.9  6e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  38.14 
 
 
121 aa  73.9  7e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  1.03216e-06 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  42.68 
 
 
106 aa  73.6  9e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.57 
 
 
352 aa  72.8  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  49.3 
 
 
681 aa  72.8  1e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.48 
 
 
358 aa  73.2  1e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  50 
 
 
129 aa  73.2  1e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  50.7 
 
 
350 aa  72.8  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  50.75 
 
 
350 aa  72  3e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  53.33 
 
 
357 aa  72  3e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  47.89 
 
 
129 aa  71.6  3e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.33 
 
 
360 aa  71.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  45.98 
 
 
103 aa  70.5  6e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.67 
 
 
375 aa  70.5  7e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.53 
 
 
358 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.33 
 
 
358 aa  70.5  8e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.67 
 
 
375 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  41.98 
 
 
105 aa  69.7  1e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.37 
 
 
358 aa  69.3  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.37 
 
 
358 aa  69.3  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.37 
 
 
358 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.9 
 
 
358 aa  69.7  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.23 
 
 
365 aa  69.7  1e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>