15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0439 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0439  plastoquinol terminal oxidase  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0881752  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  30.65 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  26.2 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5300  predicted protein  27.59 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0341  plastoquinol terminal oxidase  29.01 
 
 
169 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0429  plastoquinol terminal oxidase  33.04 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03651  hypothetical protein  26.43 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.641535  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11341  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502236 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03641  hypothetical protein  29.51 
 
 
169 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  28.41 
 
 
531 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10319  predicted protein  26.74 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0970285  normal  0.563011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3824  alternative oxidase  27.42 
 
 
164 aa  44.7  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  27.94 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  26.47 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  30.21 
 
 
401 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>