38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0420 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  69.09 
 
 
119 aa  156  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  82.73 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  65.31 
 
 
99 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  64.29 
 
 
99 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  56 
 
 
102 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  53.76 
 
 
104 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  54.44 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  51.61 
 
 
101 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  58.82 
 
 
97 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  57.14 
 
 
95 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  55.29 
 
 
94 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  54.76 
 
 
97 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  59.21 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  59.21 
 
 
96 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  53.57 
 
 
94 aa  94.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  56.25 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  43.84 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  54.55 
 
 
57 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  29.63 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  29.63 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  29.63 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  28.4 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  30.3 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  31.94 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  25.33 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  30.16 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  31.65 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  27.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  27.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  28.4 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  27.14 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  27.87 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  30.3 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  28.89 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>