23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0417 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  72.05 
 
 		 176 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  65.08 
 
 		 133 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  35.81 
 
 		 197 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  31.21 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.56 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  34.56 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.07 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  31.54 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  31.54 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  29.14 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  24.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32.05 
 
 		 438 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  23.39 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  23.39 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  38.67 
 
 		 1014 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  22.61 
 
 		 441 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  31.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.38 
 
 		 443 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.18 
 
 		 403 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.38 
 
 		 440 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>