More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0407 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  100 
 
 		 428 aa  877    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  85.24 
 
 		 426 aa  755    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  71.63 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  65.3 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  61.89 
 
 		 416 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  62.14 
 
 		 416 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  59.61 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.28 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  57.52 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  58.62 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.19 
 
 		 420 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  56.93 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.35 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.35 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  58.58 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 423 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.97 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  53.66 
 
 		 420 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  54.15 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.81 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  49.64 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.03 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.23 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.19 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.77 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  48.67 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.51 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.82 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  51.55 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.76 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.03 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.97 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.9 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.65 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.29 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.79 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.41 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  46.04 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.24 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.79 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.79 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.79 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  48.86 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.04 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.85 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  46.04 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  46.04 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.54 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  46.93 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  45.79 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.54 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.7 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.09 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.72 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  45.79 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  50.24 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.68 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.53 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.4 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.37 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.43 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.14 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.68 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.69 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.42 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.01 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  46.6 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 415 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.87 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.87 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.04 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.73 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.03 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  46.27 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.38 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.08 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.34 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.91 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  46.27 
 
 		 414 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  46.02 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  45.69 
 
 		 626 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.02 
 
 		 415 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.12 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.89 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  46.95 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 608 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>