More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0339 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
400 aa  808    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  77.94 
 
 
400 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  65.75 
 
 
427 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  43.41 
 
 
391 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
392 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
392 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  41.65 
 
 
395 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
396 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  44.42 
 
 
397 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  37.85 
 
 
434 aa  272  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  42.09 
 
 
397 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
657 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
640 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
359 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
677 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2550  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.930398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
377 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
1162 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 
391 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
646 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
644 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
826 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
797 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1435 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
438 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
798 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
754 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
444 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
585 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  43.38 
 
 
253 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
633 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
875 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
444 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
877 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  34.6 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  43.38 
 
 
253 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
253 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
493 aa  93.2  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.21 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  27.21 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  27.21 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0802  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
386 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.21 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
1523 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  45.54 
 
 
257 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
359 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
1268 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  42.54 
 
 
250 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3669  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.962708 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4746  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  30.32 
 
 
183 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.67 
 
 
269 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 
857 aa  90.1  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  46.79 
 
 
255 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.89 
 
 
365 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  46.32 
 
 
363 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
1523 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.77 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
250 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
250 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
250 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  36.36 
 
 
256 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 
256 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  51.69 
 
 
253 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
251 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
356 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4733  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0220  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
608 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3656  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  25.57 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  42.57 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  45.87 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.57 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.91 
 
 
255 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
257 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
257 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0392  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 
260 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
363 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0347  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 
260 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  45 
 
 
521 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
535 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
878 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  38.06 
 
 
259 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.48 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>