More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0334 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0334  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2357  HesB/YadR/YfhF  91.54 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26221  hypothetical protein  77.52 
 
 
130 aa  206  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01321  hypothetical protein  71.54 
 
 
130 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00565466  normal  0.345685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1485  hypothetical protein  73.81 
 
 
129 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.885588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01901  hypothetical protein  73.02 
 
 
129 aa  186  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01301  hypothetical protein  63.08 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0119  hypothetical protein  61.54 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01341  hypothetical protein  61.54 
 
 
132 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01331  hypothetical protein  61.54 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0909  HesB/YadR/YfhF  65.57 
 
 
118 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0796316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.38 
 
 
118 aa  146  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.91 
 
 
118 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.91 
 
 
118 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  55.28 
 
 
118 aa  144  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.28 
 
 
118 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.29 
 
 
117 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.02 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14867  predicted protein  60 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.47906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.49 
 
 
108 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.75 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
115 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.88 
 
 
122 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
115 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.36 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.17 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.39 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.02 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  41.07 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.23 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  42.11 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.96 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  38.39 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  38.39 
 
 
126 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.96 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.39 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  40.77 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.39 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.07 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  40.18 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.59 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  41.07 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  41.07 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  41.96 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
118 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  41.07 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.81 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.61 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  41.07 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  40.18 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  41.07 
 
 
107 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  38.39 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  36.89 
 
 
126 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
106 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  40 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  39.29 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  39.09 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  36.61 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.09 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.29 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.47 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  39.29 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.61 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.88 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.39 
 
 
106 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  40.18 
 
 
107 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.94 
 
 
120 aa  87  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  39.29 
 
 
107 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.39 
 
 
106 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.29 
 
 
107 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.35 
 
 
108 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.18 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>