129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0324 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  77.31 
 
 
513 aa  783    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  100 
 
 
510 aa  1033    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  75.93 
 
 
500 aa  746    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  56.99 
 
 
543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  54.49 
 
 
528 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  51.15 
 
 
555 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  52.05 
 
 
531 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  53.3 
 
 
518 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  52.54 
 
 
561 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  51.87 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  51.32 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  53.7 
 
 
475 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.07 
 
 
543 aa  279  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  36.43 
 
 
544 aa  276  9e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  38.86 
 
 
548 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  37.32 
 
 
515 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.72 
 
 
531 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  36.4 
 
 
515 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  75.15 
 
 
188 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.43 
 
 
518 aa  257  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  39.2 
 
 
574 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  36.2 
 
 
533 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  37.13 
 
 
550 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  35.47 
 
 
542 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  36.36 
 
 
531 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  37.79 
 
 
561 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  34 
 
 
639 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  33.89 
 
 
643 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  35.34 
 
 
491 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  34.86 
 
 
530 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  34.21 
 
 
571 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  34.91 
 
 
539 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  32.21 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  34.32 
 
 
624 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  33.89 
 
 
563 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.97 
 
 
604 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.4 
 
 
629 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  35.4 
 
 
578 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  32.74 
 
 
581 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  32.74 
 
 
581 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  34.74 
 
 
529 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  32.69 
 
 
551 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  33.56 
 
 
622 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.72 
 
 
450 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  49.37 
 
 
658 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.57 
 
 
589 aa  197  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  56.77 
 
 
572 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  31.65 
 
 
586 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  31.65 
 
 
586 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  30.83 
 
 
600 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  31.07 
 
 
641 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.55 
 
 
432 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.76 
 
 
591 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  30.12 
 
 
426 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  29.37 
 
 
593 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  34.29 
 
 
390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  32.2 
 
 
415 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  34.19 
 
 
645 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  34.28 
 
 
632 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  30.13 
 
 
432 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  35.57 
 
 
409 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  30.53 
 
 
568 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  31.37 
 
 
606 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  34.9 
 
 
384 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  30.75 
 
 
414 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  48.57 
 
 
666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  48.57 
 
 
666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.09 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  28.36 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  45.66 
 
 
550 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  39.67 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  29 
 
 
383 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  35.31 
 
 
440 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  35.32 
 
 
449 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  29.43 
 
 
371 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  42.34 
 
 
261 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  42.16 
 
 
262 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  42.16 
 
 
262 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  25.6 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  35.2 
 
 
335 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  29.8 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  28.24 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.77 
 
 
416 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.23 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  33.67 
 
 
336 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  25.49 
 
 
385 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  37.5 
 
 
673 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  35.58 
 
 
946 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.34 
 
 
932 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  25.44 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 
919 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  32.65 
 
 
441 aa  57  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  26.03 
 
 
328 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  26.04 
 
 
369 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  39.56 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  26.19 
 
 
328 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  26.4 
 
 
333 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.76 
 
 
1036 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.84 
 
 
361 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>