118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0248 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  64.3 
 
 		 497 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  100 
 
 		 489 aa  998    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  89.32 
 
 		 488 aa  904    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  64.3 
 
 		 497 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  70.21 
 
 		 507 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  67.3 
 
 		 495 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  57.73 
 
 		 495 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  58.21 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  58.63 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  58.04 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  49.69 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  50.72 
 
 		 493 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  45.38 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  45.38 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  45.81 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  45.27 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  43.3 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  36.13 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  32.63 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  31.32 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  31.32 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  31.68 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  30.99 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  32.81 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  30.67 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  31.16 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  30.17 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  29.7 
 
 		 765 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  31.25 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  29.54 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  30.89 
 
 		 470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  30.25 
 
 		 514 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  29.01 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  31.74 
 
 		 467 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  26.86 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  32.64 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  28.75 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  27.53 
 
 		 630 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  29.9 
 
 		 488 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  32.59 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  32.24 
 
 		 481 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  29.21 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.98 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  30.08 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  30.58 
 
 		 481 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  25.22 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  28.8 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  25.43 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  31.81 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  32.25 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  30.8 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  29.18 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  25.72 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  28.35 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  29.47 
 
 		 504 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  43.56 
 
 		 163 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.46 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  30.88 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  27.29 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  29.5 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  28.72 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  28.72 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  31.9 
 
 		 515 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  28.05 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  28.05 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  28.51 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  27.9 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  29.54 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.69 
 
 		 473 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  28.48 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  26.5 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  27.98 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  26.3 
 
 		 914 aa  130  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  29.2 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  29.2 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  29.08 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  27.44 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  27.2 
 
 		 480 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  28.66 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  28.45 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  25.48 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  25.67 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  28.6 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.36 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  27.36 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  28.04 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  30.28 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  29.97 
 
 		 558 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  29.65 
 
 		 554 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  25.64 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  29.97 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  25.84 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  25.84 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  25.84 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  25.84 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  25.84 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>