More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0247 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  89.5 
 
 
202 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  83.58 
 
 
209 aa  348  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  80 
 
 
208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.29 
 
 
209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.92 
 
 
213 aa  318  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.25 
 
 
203 aa  317  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.25 
 
 
203 aa  317  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.74 
 
 
207 aa  309  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.08 
 
 
201 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.74 
 
 
209 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.23 
 
 
236 aa  307  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.57 
 
 
201 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.08 
 
 
201 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.26 
 
 
201 aa  303  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.16 
 
 
198 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.05 
 
 
195 aa  254  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.97 
 
 
195 aa  247  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
196 aa  241  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
199 aa  240  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
202 aa  239  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.97 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
196 aa  238  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
197 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
202 aa  237  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
202 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
202 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.04 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
206 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
206 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  227  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  227  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  226  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
198 aa  225  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
197 aa  225  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
197 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
196 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  225  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
194 aa  225  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  224  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  223  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  222  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  222  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
199 aa  221  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
200 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  221  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
196 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
200 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
203 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2805  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  218  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
197 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
197 aa  218  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
201 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>