More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0163 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
256 aa  493  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  81.64 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  68.7 
 
 
270 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  58.14 
 
 
262 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  58.2 
 
 
262 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  51.59 
 
 
262 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  52.99 
 
 
262 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  50.79 
 
 
262 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  53.02 
 
 
270 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  55.26 
 
 
262 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  46.06 
 
 
255 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  44.4 
 
 
273 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 
269 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  44.25 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  44.69 
 
 
270 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 
266 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  44.25 
 
 
270 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
406 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
406 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.49 
 
 
462 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.33 
 
 
706 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
685 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.67 
 
 
582 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
878 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  35.14 
 
 
539 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.26 
 
 
706 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.31 
 
 
810 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  32.73 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.94 
 
 
334 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.04 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
681 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.1 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
404 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
446 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.13 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
1421 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.96 
 
 
725 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
605 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
718 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
689 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
371 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
649 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 
542 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 
738 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
3145 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 
1056 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
331 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
909 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.58 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 
988 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.29 
 
 
622 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.86 
 
 
816 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 
1022 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  35.71 
 
 
535 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
784 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.51 
 
 
471 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
1056 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.77 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.13 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.16 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.13 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.13 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
636 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 
612 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
422 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 
626 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
635 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 
458 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
1240 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
635 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
833 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.72 
 
 
875 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>