More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0154 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 509 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 573 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 488 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 573 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  75.95 
 
 		 513 aa  788    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 561 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 573 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1022    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  86.83 
 
 		 502 aa  895    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 512 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 504 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  75.2 
 
 		 503 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  76.15 
 
 		 513 aa  789    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 		 512 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  82.49 
 
 		 508 aa  833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 		 512 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  58.28 
 
 		 485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  57.06 
 
 		 607 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 491 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 497 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 493 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 647 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 499 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  53.28 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 495 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 501 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 499 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 488 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 489 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 631 aa  482  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.1 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.61 
 
 		 771 aa  475  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 497 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.69 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 498 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 506 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 505 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>