More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0100 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  100 
 
 		 468 aa  963    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4769  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.48 
 
 		 224 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1594  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.11 
 
 		 238 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 		 209 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2838  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.94 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0478291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.35 
 
 		 263 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1883  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 225 aa  96.7  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.22 
 
 		 214 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  27.5 
 
 		 237 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  31.55 
 
 		 264 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  31.09 
 
 		 228 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0054  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.23 
 
 		 231 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.77 
 
 		 231 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0163138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.36 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14211  hypothetical protein  31.92 
 
 		 219 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  30.27 
 
 		 208 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  28.96 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.24 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.53 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.35 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36315  predicted protein  25.69 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.02 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 227 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  24.34 
 
 		 238 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  23.23 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 210 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  24.21 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  24.48 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  25.43 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.78 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  29.17 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.65 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.47 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.43 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 		 227 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.51 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  28.65 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  27.63 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.69 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.18 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.98 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  22.73 
 
 		 291 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  23.94 
 
 		 216 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  22.92 
 
 		 207 aa  67  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  26.84 
 
 		 223 aa  67  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  27.84 
 
 		 214 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  22.34 
 
 		 260 aa  67  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.81 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.14 
 
 		 254 aa  66.6  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  22.68 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  27.6 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.6 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  29.14 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  24.46 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  27.27 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.37 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>