34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0076 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0076  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  246  8e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.648217  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00781  hypothetical protein  68.15 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  43.7 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  36.97 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  35.45 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  35.45 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2616  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.506732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 
117 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  34.55 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  34.55 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.41 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1258  membrane protein of unknown function  30.43 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184033  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  32.43 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  30.36 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  32.73 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  31.48 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  38.32 
 
 
113 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  36.44 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  34.86 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>